新鲜的牛肚可以用盐搓洗，或者用面粉反复揉搓，之后用清水冲洗。一般新鲜的牛肚上面都有一股异味，可以用醋涂抹在牛肚上面，即可去除异味。再者进行焯水，能将牛肚上的异味全部消除，同时还能洗去血水。
如果是较大一块牛肚，可以将牛肚撕成一小块，简单冲洗一下，然后把撕开的牛肚，放入盆中，加入适量食盐，倒入清水。盐具有杀菌效果，而牛肚上的寄生虫等对人体都有害处，用盐浸泡能起到杀菌的作用。
用食盐浸泡好后，进行滤水，再置入盆中加食用醋，能去除牛肚的腥味。这样一来，就能将买回家的新鲜牛肚清洗干净了。还有一种处理方法，就是将牛肚分成小块，放入冷水锅里，边加热边用小刀刮洗，直到水烧沸，牛肚变软，再取出，用水反复冲洗干净。
如果不食用的话，可以将牛肚放进冰箱里冷冻保存，当然，若打算在短期内吃完，可以放进冰箱里冷藏。如果是已经将牛肚煮熟了，要用保鲜膜包好，再放在冰箱里冷冻，可以保存很长一段时间。
